In 1948 werd hij benoemd tot hoogleraar in de Oogheelkunde, bouwde hij de oogheelkundige kliniek van de RUG in korte tijd uit tot een centrum met internationale faam.
De uitgebreidheid van zijn wetenschappelijke productie is ongetwijfeld een unicum in de medische literatuur. Van zijn hand verschenen meer dan 30 boeken en talloze artikels.
Zijn faam heeft heel wat buitenlanders naar Gent aangetrokken. Zo telt de lijst van alumni van de Oogheelkundige Kliniek meer dan 100 namen afkomstig uit 33 verschillende landen. J. François was tevens voorzitter, secretaris, erelid of lid van meer dan 120 wetenschappelijke verenigingen.
21 buitenlandse universiteiten verleenden hem het eredoctoraat. Hij ontving talloze penningen en medailles waaronder de Gonin-medaille, de meest prestigieuze in de Oogheelkunde.
